Die Arbeit von MSF ist vor allem medizinischer Natur und umfasst hauptsächlich Hilfsmassnahmen für notleidende Menschen, ungeachtet dessen, in welchem Land sie sich befinden. Denn in zahlreichen Regionen auf der ganzen Welt ist das Gesundheitssystem nicht funktionsfähig, sei dies wegen Krieg, Natur- oder von Menschen verursachten Katastrophen oder ganz einfach wegen fehlender finanzieller oder logistischer Mittel.
Eines der Hauptziele von MSF ist es deshalb sicherzustellen, dass alle Zugang zu medizinischer Grundversorgung haben. Die medizinischen Tätigkeiten umfassen aber mehr als die Grundversorgung.
Bei einer akuten Krise braucht es manchmal neben der medizinischen Arbeit weitere Hilfsmassnahmen in Bereichen wie Wasserversorgung, Nahrungsverteilung, Bau von Unterkünften oder sanitäre Anlagen.
Diese Arbeit konzentriert sich auf Krisensituationen, in denen ein früher existierendes soziales Gleichgewicht nicht mehr besteht und auf Situationen, in denen Menschenleben bedroht sind.
Der medizinische Tätigkeitsbereich umfasst vorwiegend Chirurgie, Impfungen und die Behandlung von bestimmten Krankheiten, die gravierende Auswirkungen auf die öffentliche Gesundheit haben. Dazu gehört zum Beispiel die Tuberkulose, insbesondere deren multiresistente Formen.
Dank bedeutender technischer Mittel, der grossen Erfahrung und ständiger Präsenz vor Ort spielt MSF heute in Forschung und Entwicklung eine wichtige Rolle.
Um auch nach der Überwindung von Krisensituationen medizinische Qualitätsarbeit zu gewährleisten, hat MSF sich zusätzlich in Bereichen wie der Sanierung und dem Aufbau von Gesundheitseinrichtungen, der medizinischen Ausbildung und der Gesundheitsförderung spezialisiert.